تفسیر ژن های انسان با کمک فناوری جدید
این فناوری راه را برای شناسایی داروهای جدیدی که بسیاری از بیماریهای ژنتیکی را درمان میکنند هموار میسازد.
این فناوری که TargetFinder نام دارد به محققان کمک میکند تا به جهشهای موجود در "ماده تاریک" با ژنهایی که آنها را تحت تاثیر قرار میدهد پرداخته تا به طور بالقوه بتوانند هدفهای درمانی جدیدی را برای اختلالات ژنتیکی بیابند.
به گفته کاترین پولارد مولف این پژوهش از موسسه گلدستون در سان فرانسیسکو، اکثر جهشهای ژنتیکی که با بیماریها در ارتباط هستند در افزایندهها رخ میدهند و آنها را به یک بخش فوق العاده مهم در این پژوهش تبدیل کردهاند.
افزاینده به بخش کوتاهی از دیانای میگویند که میتواند به برخی پروتئینهای ویژه بچسبد و با این کار رونویسی ژن را در یک خوشه ژن افزایش دهد. با اینکه افزایندهها گونهای سامان دهنده همسو هستند ولی نیازی نیست که نزدیک ژنهایی باشند که روی آنها اثر میگذارند. با این وجود گاهی برای کارکردشان نیاز است که بر روی همان کروموزومی باشند که ژن بر رویش جای دارد.
هنگامی که یک افزاینده دور از ژنی قرار دارد که آن را تحت تاثیر قرار میدهد، این دو با تشکیل یک حلقه سه بعدی، مثل کمان در ژنوم به یکدیگر متصل میشوند.
با استفاده از فناوریهای آموزشی جدید که به تازگی در مجله Nature Genetics ژنتیک منتشر شده است، محققان موفق به تجزیه و تحلیل صدها داده موجود از شش نوع سلول مختلف برای بررسی الگوهای موجود در ژنوم شدند که به شناسایی تعامل ژن و افزاینده میپردازد.
آنها چندین الگو که در حلقهها وجود داشته و افزایندهها را به ژنها متصل میکند را کشف کردند. این الگو به دقت به پیش بینی 85 درصدی تعامل بین افزاینده و ژن میپردازد.
پیش از این هیچ فردی به بررسی اطلاعات ذخیره شده موجود بر روی این حلقهها نپرداخته بود، به همین علت اهمیت این اطلاعات به دست آمده سبب شگفتی محققان شد.
به گزارش ایسنا، انجام آزمایشات در آزمایشگاه برای شناسایی تمام این تعاملات که بین ژن و افزاینده ها وجود دارد، نیازمند میلیونها دلار هزینه و سالها تحقیق است اما این روش محاسباتی جدید یک راه بسیار ارزان برای شناسایی اتصالات ژن و افزاینده در ژنوم است که همچنین نیازمند صرف وقت کمتری میباشد.
No tags for this post.