بررسی ظرفیت میکروبیوم های دریای خزر با یک روش جدید
دکتر ابوالحسن شاهزاده فاضلی در گفتگو با مهر اظهار داشت: در پژوهش انجام شده با استفاده از روشهای توالی یابی پر بازده، ساختار جمعیت میکروبی دریای خزر تعیین و ژنوم میکروب های شاخص آن بازسازی شد.وی افزود: همچنین در این پژوهش نمونه های میکروبی از سه عمق ۱۵، ۵۰ و ۱۵۰ متری ستون آبی منطقه جنوبی دریای خزر جمع آوری شدند تا توالی ژن ۱۶S rRNA در آنها مورد بررسی قرار گیرد.
شاهزاده فاضلی عنوان کرد: نتایج حاصل، تشابه ساختار کلی جمعیت میکروبی در هر سه عمق را نشان داده است اگر چه تفاوت هایی با ساختار جامعه میکروبی در محیطهای آبی اقیانوسی و آب شیرین محیط های معتدل به چشم می خورد.
رئیس مرکز ذخایر زیستی و ژنتیکی عنوان کرد: ژنوم های مونتاژ شده بر حضور میکروارگانیسم هایی در گروه های Actinobacteria، Alphaproteobacteria، Betaproteobacteria، Gammaproteobacteria، Bacteroidetes، Cyanobacteria، Euryarchaeota و Thaumarchaeota دلالت دارند.
فاضلی خاطر نشان کرد: نتایج بررسی ژنوم های به دست آمده مربوط به اعماق مختلف دریای خزر نشان دهنده تفاوت های بارز در سطوح پایین تر تاکسونومیکی در سه عمق مختلف بود که می تواند تحت تاثیر نور یا دما باشد.
وی ادامه داد: توصیف دقیق تر ژنومهای مربوط به شاخه های Actinobacteria و Thaumarchaeota و رده Alphaproteobacteria به عنوان گروه های تاکسونومیکی که اعضای آن از نظر فیلوژنتیکی به تغییر درصد شوری در محیط پاسخ می دهند نشان داد که بیشتر ژنومهای جدا شده از دریای خزر متعلق به گروه های معرفی نشده میکروبی و بسته به مورد دارای ارتباط نزدیکتر به یکی از گروه های آب شیرین و یا آب اقیانوسی هستند.
به گفته وی، الگوی فیلوژنتیک ژنوم های دریای خزر نشان دهنده مبداهای فیلوژنتیکی چندگانه و مجزای ژنوم های خزر بود که مرتبط با گروههای مشابه متعلق به آب شیرین و اقیانوسی است.