مهندس جعفری در دوره قبل شورای عالی فضای مجازی کشور، مشاور رییس مرکز و مجری طرح 'تدوین معماری جمهوری اسلامی در فضای مجازی' بوده است.
به گزارش ایرنا از مرکز ملی فضای مجازی کشور، وی همچنین علاوه بر فعالیت های علمی و آموزشی در این حوزه، فعالیت های پژوهشی خود را با تاسیس و مدیریت پژوهشکده های امنیت فناوری اطلاعات و ارتباطات در مرکز تحقیقات مخابرات ایران و مرکز پژوهش امنیت سامانه های رایانه ای (یاس) آغاز کرد و در حوزه های اجرایی، مراکز فناوری اطلاعات ریاست جمهوری و مدیریت راهبردی افتا را تاسیس، تکمیل و شبکه اختصاصی دولت را مدیریت کرده است.